Naturparkens sekretariat (Koordinering, PR, naturvejleder, fælles arrangementer mv.) drives af Egedal og Furesø kommuner.

Naturvejleder og administrativ medarbejder/sekretær for Naturpark Mølleåen er Kristoffer Schou: kristoffer.schou@egekom.dk og tlf. 7259 7222.